UE BIOMED

Imagerie Biologique et Médicale - Biomedical imaging (BIOMED)

2022 - 2023

Cours le mercredi matin à 8h30 - Lectures on Wednesday morning (8:30am)
Programme :
- 21/9 : Introduction, principes de l'imagerie par rayons X, scanner, imagerie nucléaire, imagerie ultrasonore, imagerie par résonance magnétique, électrophysiologie -- Introduction, principles of several medical imaging methods (X-rays, scanner, nuclear imaging, ultrasound, MRI...) (Isabelle Bloch)
- 28/9 : Recalage d'images - Image registration (Pietro Gori) 2h cours + 2h TP
- 5/10 : Modèles de forme - Shape models (Pietro Gori) 2h cours + 2h TP
- 12/10 : Reconstruction tomographique - Tomographic reconstruction (Isabelle Bloch)
- 19/10 : Applications : imagerie de la rétine, imagerie cardio-vasculaire, mammographie... - Various applications (Isabelle Bloch)
- 26/10 : Filtrage et segmentation : TP - Practical work in filtering and segmentation (Isabelle Bloch, Garance Martin)
- 9/11 : Applications et révisions (Isabelle Bloch)
- 23/11 - 8h30-10h30 : Examen réparti 1 (sur les cours en imagerie médicale) - First exam on the courses on medical imaging - Seul document autorisé : une feuille A4 recto-verso de notes / Only on recto-verso sheet of notes authorized
- 30/11 : Introduction à l'imagerie biologique, microscopie photonique, vidéomicroscopie (Philippe GUILLAUD)
- 7/12 : Microscopie électronique et traitement d'images (Catherine VENIEN-BRYAN)
- 14/12: Détection et suivi de particules fluorescentes (Vannary MEAS-YEDID) - 2h Cours puis 2h TP - Logiciel à installer avant le TP : ICY + Eclipse
- 4/1 : Colocalisation, segmentation et suivi de cellules (Vannary MEAS-YEDID) - 2h Cours puis 2h TP
- 11/1 : Microscopie confocale (CLSM) et microscopie bi-photonique, super-résolution (Philippe GUILLAUD)
- 18/1 Cours à 10h : Microscopie confocale et spinning-disk (Romain MORICHON) - CISA, Faculté de Médecine de Saint Antoine, 6ième étage, pièce 608, 27 rue de Chaligny, 75012 Paris (sous réserve)
- 25/1 : Analyse histologique (Vannary MEAS-YEDID) - 2h Cours +2h TP
- 8/2 : examen réparti 2 (sur les cours en imagerie biologique)

Examen : la note sera composée des notes des deux examens répartis, et des comptes-rendus de TP

Course material in English:
- Introduction and principle of the main acquisition methods
- Tomographic reconstruction
- Image registration
- Landmark-based registration and shape analysis
- Applications: Cardio-vascular imaging
- Applications: Mammography
- Biological imaging (some of the slides are in French)
Supports de cours des années précédentes :
- Support de cours sur l'introduction à l'imagerie médicale
- Polycopié sur la reconstruction tomographique et support de cours
- Support de cours sur l'imagerie ultrasonore
- Support de cours sur l'imagerie par résonance magnétique
- Support de cours sur l'imagerie par rayons X
- Support de cours sur l'imagerie nucléaire
- Support de cours sur l'IRM de diffusion, l'EEG et la MEG
- Support de cours sur le recalage
- Support de cours sur l'analyse statistique de formes
- TP sur l'analyse statistique de formes : code et sujet
- Exemples en imagerie cérébrale
- Exemples en imagerie cardiaque et vasculaire
- Exemples en mammographie
- Exemples en imagerie ophtalmologique
- Supports des cours en imagerie biologique
- Sujet d'examen 2009-2010, à titre d'exemple pour la partie d'imagerie médicale.