ENST Imagerie médicale  CNRS
  Département TSI   CNRS UMR 5141 LTCI



Imagerie cardio-vasculaire :


Imagerie cérébrale :

Echographie 3D :


Imagerie thoracique :

Modélisation 3D : Mammographie numérique 3D :




Contact : Isabelle Bloch
Isabelle.Bloch@enst.fr


Reconstruction régularisée d'images de résonance magnétique  3D de haute résolution à partir d'acquisitions de résolution dégradée  de façon anisotrope
Thèse d'Elodie Roullot (en collaboration avec Alain Herment et Elie Mousseaux, INSERM)
 


 
 

Deux coupes correspondantes  des volumes anisotropes acquis.
Reconstruction sans contraintes Reconstruction avec contrainte de douceur, mais sans contrainte de préservation des contours Reconstruction avec contraintes de douceur et de préservation des contours



Modélisation du coeur et de ses déformations
Thèse d'Anne Robert (en collaboration avec Elie Mousseaux)
 
 
 
Acquisition 3D en IRM Modélisation par des superquadriques Volume du ventricule gauche au cours du temps



Segmentation des vaisseaux sanguins en angiographie 3D
Thèse de Bert Verdonck (en collaboration avec Dirk Vandermeulen et Paul Suetens, univ. Leuven)


 


 
 
 


 


 
 
 
 



Segmentation des coronaires en CT 3D de haute résolution
Thèse de David Lesage (en collaboration avec Siemens, Princeton)


 
 
 



Reconstruction et segmentation du coeur en IRM
Thèse de Racha El Berbari (en collaboration avec Alain Herment et Frédérique Frouin, INSERM)


 
 
 



Segmentation des matières par modèles déformables implicites
Travaux d'Elsa Angelini en collaboration avec Columbia University
 


 



Segmentation de structures anatomiques
Thèses de Jean-François Mangin, Thierry Géraud, Yann Cointepas, Hilmi Rifai
Post-doc de Petr Dokladal
 
 


 
 


 

Segmentation du cerveau, du cervelet et du tronc cérébral


 

   Segmentation de la peau, les muscles, l'os, le cerveau, le cervelet, le tronc cérébral
 
 
 



Segmentation du crâne
Thèse d'Hilmi Rifai (en collaboration avec Seth Hutchinson, Univ. Urbana Champaign, et Joe Wiart, CNET France Telecom)


 



Segmentation et modélisation de l'oreille interne
Thèse d'Hilmi Rifai (en collaboration avec Seth Hutchinson, Univ. Urbana Champaign, et Joe Wiart, CNET France Telecom)


 


 



Segmentation et reconnaissance des sillons corticaux
Thèse de Jean-François Mangin (en collaboration avec le CEA-SHFJ)
 


 
 


 


 


 




Segmentation fine du cortex
Thèse de Yann Cointepas (en collaboration avec Line Garnero, LENA Salpétrière)


 



Parcellisation et modélisation de l'évolution du cortex
Thèse d'Arnaud Cachia (en collaboration avec Jean-François Mangin, CEA-SHFJ)


 
 



Reconnaissance de structures internes dans des images IRM
Thèses de Thierry Géraud, Aymeric Perchant, Olivier Colliot, Olivier Nempont (en collaboration avec Dominique Hasboun, hôpital La Pitié Salpétrière)
 


 
 

Contraintes par rapport à des structures reconnues Localisation approximative fournie par l'atlas Information fournie par les niveaux de gris de l'image Position relative par rapport à des structures reconnues Position relative par rapport à des structures reconnues (vue 3D)

 
 
Superposition de l'atlas et de l'image avant reconnaissance du noyau caudé Localisation approximative fournie par l'atlas Fusion des informations Segmentation et reconnaissance du noyau caudé

 
Quelques structures de l'atlas Structures reconnues dans l'image




Intégration de relations spatiales dans des modèles déformables
Thèse d'Olivier Colliot, avec une contribution d'Oscar Camara (en collaboration avec Dominique Hasboun, Pitié-Salpétrière), thèse d'Olivier Nempont
 


 
 


 
 


 
 



Mesures de symétrie
Thèse d'Olivier Colliot (en collaboration avec Alexander Tuzikov, Minsk)
 


 
 


 
 



Recalage anatomo-fonctionnel
Thèse de Jean-François Mangin (en collaboration avec le CEA-SHFJ)
 


 
 
 


 


 


 



Détection d'activations en imagerie fonctionnelle
Thèse d'Olivier Coulon (en collaboration avec Vincent Frouin et Jean-François Mangin, CEA-SHFJ)
 
 


 


 


 


 


 


Analyse multi-échelles d'images fonctionnelles (TEP our IRMf)et mise en correspondance de graphes
Superposition de zones d'activation motrice primaire (main droite) sur l'anatomie Localisation d'une activation liée à une vibration dans la main par rapport à deux sillons corticaux



Maillages des tissus de la tête pour la résolution des problèmes direct et inverse en électro-encéphalographie et magnéto-encéphalographie, et pour la simulation de la propagation d'ondes électromagnétiques
Thèse de Jérémie Pescatore (en collaboration avec le Line Garnero, LENA Salpétrière)
Post-doc d'Elena Martinez
Post-docs de Najib Gadi et Jasmine Burguet (en collaboration avec l'INRIA et France Télécom R&D)
 


 


 
 

Image IRM 3D Segmentation de la peau, l'os, le cerveau

 
 
Maillage de haute résolution Surface d'un maillage tétraédrique Maillage lissé



Etude de l'effet des ondes électromagnétiques sur les tissus de la tête
Post-doc de Jorge Marquez (en collaboration avec Alcatel et le projet RNRT COMOBIO)


 Acquisition d'une image de profondeur de tête, maillage triangulaire après filtrage, constituant un modèle de tête.


Mesures morphologiques sur l'oreille.


Oreille moyenne intégrée au fantôme générique.
 


Représentation sous forme de voxels servant de base aux simulations numériques de propagation de champs, composantes voxélisées superposées au maillage.


 Calcul du SAR (« specific absorption rate ») maximum dans un cube de 10 grammes.



Extraction de faisceaux de fibres de matière blanche en IRM de diffusion
Thèse de Cyril Poupon (en collaboration avec Jean-François Mangin, CEA-SHFJ)
 



Détection de tumeurs cérébrales
Thèses de Lars Aurdal, Aymeric Perchant (en collaboration avec Catherine Adamsbaum, hôpital Saint-Vincent de Paul), Hassan Khotanlou


 
 


 
 



Modélisation des connaissances et GRAFIP (graphe de représentation anatomique et fonctionnelle individualisé intégrant les pathologies)
Travaux structurant l'ensemble de l'équipe. Post-docs de Jamal Atif, Bénédicte Batrancourt, Olivier Colliot, Céline Hudelot.



Acquisition et visualisation de données échographiques 3D
Thèse de Bruno Robert (en collaboration avec Bruno Richard. hôpital Cochin)
 
 
Reconstruction 3D d'un foetus Reconstruction 3D de la carotide et la throïde



Fusion d'acquisitions échographiques multiples
Thèse de Pau Soler (en collaboration avec Philips Medical Systems et le CHU de Caen)
 
 



Etude du mouvement cardiaque
Travaux d'Elsa Angelini en collaboration avec Columbia University
 


 



Traitement et visualisation de l'arbre bronchique (structures 3D complexes)
Thèse de Jorge Marquez


 
 



Recalage non linéaire en oncologie
Thèses de Oscar Camara, Gaspar Delso, Antonio Moreno, avec une contribution d'Olivier Colliot (en collaboration avec Segami, les hôpitaux du Val-de-Grâce, Lille, Tenon, Monaco, Liège)
 


 
 
 
 


 


 
 


 


 
 


 
 


 


 


Recalage CT-TEP : importance de la prise en compte des tumeurs (elles ne suivent pas la même déformation que les poumons).


Recalage avec contraintes de rigidité sur la tumeur.
 


Segmentation du coeur et de la tumeur.
 



Modélisation 3D du foetus et de la mère
Thèse de Jérémie Anquez (en collaboration avec l'hôpital Saint Vincent de Paul, Philips et France Télécom)



 



Reconstruction faciale à partir d'images 3D de crâne
Thèse d'Adel Kermi (en collaboration avec l'université d'Annaba)



 



Détection de microcalcifications et de masses en mammographie numérique 3D
Thèse de Gero Peters (en collaboration avec Serge Muller, General Electric)