UE BIOMED

Imagerie Biologique et Médicale - Biomedical imaging (BIOMED)

2023 - 2024

Cours le mercredi matin à 8h30 - Lectures on Wednesday morning (8:30am)
Programme :
- First part: Medical Imaging (Isabelle Bloch)
- 20/9 : Introduction, principes de l'imagerie par rayons X, scanner, imagerie nucléaire, imagerie ultrasonore, imagerie par résonance magnétique, électrophysiologie -- Introduction, principles of several medical imaging methods (X-rays, scanner, nuclear imaging, ultrasound, MRI...)
- 27/9 : Principes d'imagerie (suite) -- Imaging principles
- 4/10 : Reconstruction tomographique - Tomographic reconstruction
- 11/10 : Recalage - Registration -- Applications
- 18/10 : Filtrage et segmentation : TP - Practical work on filtering and segmentation (Garance Martin)
- 25/10 : Filtrage et segmentation : TP - Practical work on filtering and segmentation (Garance Martin)
- 8/11 : Intelligence artificielle en imagerie médicale - Artificial intelligence in medical imaging
- 15/11 - 8h30-10h : Examen réparti 1 (sur les cours en imagerie médicale) - First exam on the courses on medical imaging - Seul document autorisé : une feuille A4 recto-verso de notes / Only on recto-verso sheet of notes authorized
- Second part: Biological Imaging
- 22/11 : Introduction à l'imagerie biologique, microscopie photonique, vidéomicroscopie (Philippe GUILLAUD)
- 6/12 : Microscopie électronique et traitement d'images (Catherine VENIEN-BRYAN)
- 13/12: Détection et suivi de particules fluorescentes (Vannary MEAS-YEDID) - 2h Cours puis 2h TP - Logiciel à installer avant le TP : ICY + Eclipse
- 20/12 : Microscopie confocale (CLSM) et microscopie bi-photonique, super-résolution (Philippe GUILLAUD)
- 10/1 : Colocalisation, segmentation et suivi de cellules (Vannary MEAS-YEDID) - 2h Cours puis 2h TP
- 17/1 Cours à 10h : Microscopie confocale et spinning-disk (Romain MORICHON) - CISA, Faculté de Médecine de Saint Antoine, 6ième étage, pièce 608, 27 rue de Chaligny, 75012 Paris (sous réserve)
- 24/1 : Analyse histologique (Vannary MEAS-YEDID) - 2h Cours +2h TP
- 7/2 : examen réparti 2 (sur les cours en imagerie biologique)

Examen : la note sera composée des notes des deux examens répartis, et des comptes-rendus de TP

Course material in English:
- Introduction and principle of the main acquisition methods
- Tomographic reconstruction
- Image registration
- Applications: Cardio-vascular imaging
- Applications: Mammography
- Artificial Intelligence and Medical Imaging
- Biological imaging (some of the slides are in French)
Supports de cours des années précédentes :
- Support de cours sur l'introduction à l'imagerie médicale
- Polycopié sur la reconstruction tomographique et support de cours
- Support de cours sur l'imagerie ultrasonore
- Support de cours sur l'imagerie par résonance magnétique
- Support de cours sur l'imagerie par rayons X
- Support de cours sur l'imagerie nucléaire
- Support de cours sur l'IRM de diffusion, l'EEG et la MEG
- Support de cours sur le recalage
- Support de cours sur l'analyse statistique de formes
- TP sur l'analyse statistique de formes : code et sujet
- Exemples en imagerie cérébrale
- Exemples en imagerie cardiaque et vasculaire
- Exemples en mammographie
- Exemples en imagerie ophtalmologique
- Supports des cours en imagerie biologique
- Sujet d'examen 2009-2010, à titre d'exemple pour la partie d'imagerie médicale.